More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0159 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  49.14 
 
 
291 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 
302 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  38.83 
 
 
296 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
308 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
360 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
173 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
162 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
162 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
173 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
176 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
176 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
176 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 
165 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 
168 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
164 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  35.39 
 
 
184 aa  85.1  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.55 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 
159 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
164 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 
161 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
164 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  27.48 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
157 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 
162 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
157 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
163 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 
148 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
158 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 
175 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 
159 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
153 aa  62.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
161 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  29.86 
 
 
164 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
141 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  32.41 
 
 
167 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
162 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
167 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
153 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
141 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  35.77 
 
 
144 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  32.65 
 
 
166 aa  59.7  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
163 aa  59.3  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 
164 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
167 aa  59.3  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
164 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5854  transcriptional regulator AsnC family  31.51 
 
 
154 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  28.9 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 
164 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
167 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.93 
 
 
162 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
141 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.62 
 
 
153 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
170 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  28.48 
 
 
162 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
162 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
168 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  29.93 
 
 
162 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  37.88 
 
 
167 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  28.86 
 
 
162 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
154 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
168 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
168 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
168 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  28.86 
 
 
162 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
168 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
162 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
162 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  29.03 
 
 
137 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
168 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
168 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
162 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
168 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  31.72 
 
 
168 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
145 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  31.03 
 
 
165 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  31.01 
 
 
137 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
164 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
157 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
149 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
158 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  24.11 
 
 
156 aa  56.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
143 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
141 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  30.3 
 
 
152 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
156 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
145 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.6 
 
 
329 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  28.46 
 
 
155 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 
154 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
137 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
154 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 
153 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>