More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2937 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 173 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  31.07 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  28.98 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 163 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 161 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.56 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 155 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  32.57 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  31.36 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3605  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.641359  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  28.29 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 162 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 162 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  30.92 
 
 		 157 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 173 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.93 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  27.42 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  28.62 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.61 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  26.59 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  25.77 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  23.78 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 164 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 168 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  31.78 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 156 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 161 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2822  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.448359 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  28.35 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  28.35 
 
 		 140 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.69 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  33.07 
 
 		 167 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 		 166 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  28.7 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 		 167 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 155 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 154 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  26.9 
 
 		 155 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 164 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 159 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 		 192 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  29.08 
 
 		 169 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 163 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  27.94 
 
 		 169 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  27.94 
 
 		 169 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 161 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 157 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 		 165 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  27.94 
 
 		 152 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 154 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  27.94 
 
 		 169 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 		 173 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  27.94 
 
 		 169 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  27.94 
 
 		 152 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  27.94 
 
 		 152 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 154 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 		 173 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5098  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 169 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 		 175 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 154 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>