More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5583 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
323 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  51.56 
 
 
296 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  49.35 
 
 
338 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  39.56 
 
 
485 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  41.19 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  39.02 
 
 
329 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  33.87 
 
 
320 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.97 
 
 
329 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  34.16 
 
 
343 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 
331 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2661  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
342 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  32.57 
 
 
332 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.82 
 
 
346 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
164 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
161 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
159 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
162 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  31.68 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  27.42 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
162 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
140 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.56 
 
 
171 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  28.75 
 
 
173 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  29.38 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 
177 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
140 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  30.17 
 
 
140 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  30.17 
 
 
140 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
168 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
150 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 
158 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  30.17 
 
 
140 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 
184 aa  62.8  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
162 aa  62.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
161 aa  62.4  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  25.45 
 
 
343 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  29.19 
 
 
163 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
155 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 
163 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
176 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
176 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
176 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  29.09 
 
 
168 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
153 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  26.72 
 
 
165 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  23.78 
 
 
143 aa  59.7  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 
240 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
153 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  24.46 
 
 
140 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
154 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 
158 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
164 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.91 
 
 
164 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
150 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
157 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
150 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
157 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  29.36 
 
 
148 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
155 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
155 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 
157 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
157 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
168 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  26.41 
 
 
360 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
153 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 
157 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
151 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  30.3 
 
 
153 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.34 
 
 
181 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
155 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
154 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
152 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  24.67 
 
 
156 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 
152 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  29.32 
 
 
156 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  32.84 
 
 
167 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  31.08 
 
 
152 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
156 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
158 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
172 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
166 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 
162 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
152 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
156 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
158 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
153 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 
170 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
150 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
155 aa  53.1  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
172 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
172 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1225  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
143 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
153 aa  52.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.59 
 
 
153 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>