More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0448 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  99.29 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  97.14 
 
 		 140 aa  255  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  96.43 
 
 		 140 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  77.14 
 
 		 140 aa  224  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  49.29 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  46.43 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2162  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0889  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  35.82 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  35.07 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 149 aa  85.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 155 aa  85.9  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 157 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.78 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.01 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  31.01 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  36.69 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.91 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  30.94 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.46 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.01 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.91 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.46 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 323 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.91 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.91 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.91 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.23 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.23 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.23 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.91 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.91 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.23 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  33.86 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  32.23 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  26.81 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  27.4 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>