More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2379 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
142 aa  283  5e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  89.44 
 
 
142 aa  260  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2162  transcriptional regulator, AsnC family  76.76 
 
 
142 aa  223  8e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0889  transcriptional regulator, AsnC family  75.35 
 
 
142 aa  220  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  70.42 
 
 
142 aa  204  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  40.3 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
143 aa  104  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 
140 aa  102  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  32.56 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  36.21 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  31.15 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  25.37 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  31.39 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  30.91 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.32 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  34.82 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.89 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.82 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  34.55 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.64 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  31.3 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
164 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
162 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  25.6 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.6 
 
 
158 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.55 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  25.55 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.87 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.87 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  25.55 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
179 aa  62  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.87 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.87 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  25.55 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.87 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  25.55 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  26.77 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  26.83 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  29.6 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
169 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
158 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  25.55 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  25.55 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  25.55 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  34.82 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  25.55 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  25.55 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.51 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 
155 aa  60.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.08 
 
 
187 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  29.55 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  26.36 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>