More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0301 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 332 aa  650    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.74 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.68 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  32.7 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  34.77 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  32.82 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  32.04 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  30.63 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.41 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 154 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 148 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  26.5 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 153 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  36.51 
 
 		 171 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  26.53 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 154 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 156 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 168 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  34.43 
 
 		 157 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  36.59 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  25.98 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  32.56 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  29.87 
 
 		 162 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 155 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 174 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 174 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 		 161 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 172 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 		 155 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 174 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 172 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  26.9 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.17 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  31.78 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 173 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  31.93 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  29.61 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  33.86 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  25.68 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  37.89 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  30.51 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  27.13 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.79 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>