More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4591 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
346 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  30.03 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  28.31 
 
 
342 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
329 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.13 
 
 
331 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  29.82 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  31.06 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  27.92 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  29.82 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  25.89 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  36.8 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  27.15 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  27.14 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
157 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
157 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  27.18 
 
 
329 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
165 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
156 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
155 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 
156 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
154 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
154 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
155 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
154 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
154 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  25.36 
 
 
150 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
174 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
174 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
154 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
151 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
157 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  33.06 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
174 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
163 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
163 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
163 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
163 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  24.64 
 
 
150 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
162 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
181 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
181 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
181 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
181 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  29.3 
 
 
163 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 
161 aa  53.1  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
162 aa  53.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
168 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
157 aa  53.1  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
161 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  29.69 
 
 
152 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
168 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
160 aa  52.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
145 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  27.41 
 
 
137 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  32.52 
 
 
152 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
144 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  27.7 
 
 
162 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
163 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  28.99 
 
 
157 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
161 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  29.61 
 
 
156 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
152 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  29.55 
 
 
154 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
161 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
161 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
155 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
161 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
161 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
161 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
161 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
161 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  27.7 
 
 
160 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
163 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  28.8 
 
 
145 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  25.83 
 
 
162 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  28.69 
 
 
153 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
170 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
170 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  27.7 
 
 
162 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.26 
 
 
153 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
151 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.26 
 
 
154 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  28.69 
 
 
150 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 
145 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
162 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
162 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
152 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  27.87 
 
 
155 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
153 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
170 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  26 
 
 
162 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
158 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  26 
 
 
162 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
177 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
153 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  28.93 
 
 
153 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>