103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2726 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
329 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  38.05 
 
 
485 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  39.02 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  37.34 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  38.53 
 
 
327 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  37.21 
 
 
296 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.84 
 
 
331 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  28.92 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2661  transcriptional regulator, AsnC family  29.03 
 
 
342 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  28.03 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.18 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 
140 aa  63.9  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  35.11 
 
 
167 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
155 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 
167 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
155 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  31.15 
 
 
148 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
162 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
172 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
172 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
172 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
155 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
148 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  31.78 
 
 
157 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 
157 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  52.8  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  25.49 
 
 
153 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  25.68 
 
 
155 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 
160 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 
157 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  25.77 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0364  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.69 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
159 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 
161 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  21.26 
 
 
140 aa  50.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
164 aa  49.3  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 
152 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  28.92 
 
 
171 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  27.82 
 
 
177 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  27.52 
 
 
158 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
157 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  27.65 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  28 
 
 
171 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
168 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
343 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  32.11 
 
 
154 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  23.53 
 
 
143 aa  46.6  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
170 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  32.82 
 
 
156 aa  46.2  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 
173 aa  45.8  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  26.49 
 
 
296 aa  46.2  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  46.2  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  24.5 
 
 
173 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  28.16 
 
 
163 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  26.96 
 
 
137 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.63 
 
 
141 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1385  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 
158 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.990948  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 
141 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  32.28 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.3 
 
 
158 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  25.62 
 
 
140 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  31.19 
 
 
154 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.3 
 
 
159 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  29.9 
 
 
164 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 
157 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  25.62 
 
 
140 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
162 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  24.05 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  27.84 
 
 
161 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
155 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
167 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  25.37 
 
 
173 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 
173 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  25.62 
 
 
140 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  28.45 
 
 
159 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
154 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  25.62 
 
 
140 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
155 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  22.56 
 
 
157 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  25.71 
 
 
150 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  25.98 
 
 
165 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
164 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.78 
 
 
162 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 
157 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  24.18 
 
 
202 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  26.43 
 
 
150 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0828  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
164 aa  42.7  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
155 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  25.18 
 
 
148 aa  42.7  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3080  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 
166 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  34.15 
 
 
162 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  26.87 
 
 
176 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>