More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0778 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
137 aa  264  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  88.32 
 
 
137 aa  240  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  78.83 
 
 
137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  73.72 
 
 
137 aa  202  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  66.42 
 
 
137 aa  184  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
142 aa  84  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.56 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
171 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
167 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
164 aa  67  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 
163 aa  66.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  38.68 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  35.59 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  31.91 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  29.91 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 
177 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  26.95 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
173 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  26.12 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.47 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.34 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
168 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  30.6 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.91 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  27.35 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
145 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  35.4 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  28.87 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
192 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  25.36 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.26 
 
 
181 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  30.56 
 
 
179 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  34.45 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
153 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
299 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
170 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.14 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  27.66 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.66 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>