More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1727 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
165 aa  321  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  73.61 
 
 
171 aa  216  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  71.43 
 
 
171 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  67.59 
 
 
165 aa  204  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  64.38 
 
 
164 aa  203  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  68.03 
 
 
162 aa  201  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  69.13 
 
 
168 aa  201  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  67.74 
 
 
162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  62.76 
 
 
161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  67.81 
 
 
159 aa  196  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  65.75 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  66.44 
 
 
164 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  63.51 
 
 
173 aa  193  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  65.31 
 
 
162 aa  192  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  64.19 
 
 
173 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  65.99 
 
 
164 aa  185  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  65.54 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  65.54 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  65.54 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  62.33 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  51.01 
 
 
163 aa  149  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  39.57 
 
 
161 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
157 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
308 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
360 aa  85.5  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
302 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 
338 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
299 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  38.13 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  34.09 
 
 
291 aa  71.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  30.77 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.93 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.93 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.93 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  32.09 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.74 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  27.74 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.06 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.95 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.76 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.28 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.28 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.47 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.28 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.76 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.76 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.76 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  32.09 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  29.08 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  26.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  26.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.76 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  29.61 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.06 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>