More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1552 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 159 aa  322  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  72.9 
 
 		 164 aa  227  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  73.79 
 
 		 162 aa  224  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  73.47 
 
 		 165 aa  224  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  74.15 
 
 		 164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  72.41 
 
 		 162 aa  221  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  71.34 
 
 		 162 aa  221  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  75.68 
 
 		 171 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 161 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  71.72 
 
 		 162 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  74.5 
 
 		 171 aa  218  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 173 aa  214  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 173 aa  214  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  69.54 
 
 		 168 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  68.83 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  68.83 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  68.83 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 164 aa  200  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  66.21 
 
 		 184 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  67.81 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  44.87 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 302 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 360 aa  91.3  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  34.06 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  34.33 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 323 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 296 aa  71.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.37 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.66 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.76 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.66 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.95 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  26.9 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.24 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  30 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.24 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.53 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.53 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.53 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.43 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.76 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.24 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  26.24 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  26.24 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.24 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.24 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.24 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.24 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.24 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>