More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2729 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
137 aa  269  7e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  88.32 
 
 
137 aa  240  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  77.37 
 
 
137 aa  213  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  72.99 
 
 
137 aa  203  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  66.42 
 
 
137 aa  187  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  37.74 
 
 
338 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
173 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.47 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  33.9 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
171 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
165 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  27.61 
 
 
171 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
163 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  26.12 
 
 
165 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  29.06 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  33.04 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  26.95 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  27.78 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  26.24 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.41 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  29.32 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  28.57 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
164 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  31.67 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  31.11 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  27.01 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.37 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.97 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.95 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.97 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.97 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.97 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.95 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  22.14 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
299 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.95 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.97 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.46 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  23.02 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.27 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  27.46 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  23.78 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>