More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4617 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
173 aa  353  6.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.77 
 
 
164 aa  157  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.68 
 
 
158 aa  142  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 
167 aa  132  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 
160 aa  122  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 
154 aa  117  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 
166 aa  117  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 
159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 
156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 
157 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 
156 aa  111  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
255 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
250 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 
255 aa  96.3  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
251 aa  94.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 
264 aa  92  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.13 
 
 
158 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.52 
 
 
134 aa  79  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  34.86 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  31.67 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  31.36 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  31.96 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  34.74 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  28.85 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  30.21 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.75 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  31.69 
 
 
179 aa  62  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  32.39 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  31.2 
 
 
145 aa  61.6  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  31.67 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  40.7 
 
 
140 aa  61.6  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  26.8 
 
 
153 aa  61.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
166 aa  60.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
180 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  22.22 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  37.5 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  24.48 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  29.91 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  29.91 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  35.8 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  31.2 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  30.89 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  29.77 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  29.92 
 
 
154 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  31.46 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  33.77 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
152 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0342  transcriptional regulator  32.65 
 
 
151 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0349  transcriptional regulator  32.65 
 
 
151 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.183351 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  28.23 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  27.64 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
140 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  27.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
174 aa  57.8  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
140 aa  57.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>