More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2530 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.61 
 
 
157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.66 
 
 
159 aa  154  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.57 
 
 
158 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
164 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
156 aa  147  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 
157 aa  147  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
160 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 
250 aa  137  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
156 aa  133  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.58 
 
 
255 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 
161 aa  132  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 
154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
255 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
264 aa  103  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.21 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  28.57 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  31.61 
 
 
162 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  31.3 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
170 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3752  hypothetical protein  34.78 
 
 
170 aa  57.4  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  47.54 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.36 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  42.42 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  40.98 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  45.45 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  25.4 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  33.91 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  42.42 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  34.12 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  28.69 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
195 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  37.35 
 
 
166 aa  54.3  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  34.57 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0907  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 
199 aa  53.9  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
137 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  43.94 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  40.62 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  43.94 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  37.63 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.94 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2302  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  34.94 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  43.94 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  45.9 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  45.9 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  49.12 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5249  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.615663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>