More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0564 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  70.85 
 
 
250 aa  355  5e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  62.35 
 
 
264 aa  298  6e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.41 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 
156 aa  155  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.72 
 
 
159 aa  143  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 
164 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
160 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
167 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
154 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
156 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
157 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 
161 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
155 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 
166 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
173 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.4 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  41.86 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  39.53 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.32 
 
 
158 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  43.02 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  36.13 
 
 
149 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  30.23 
 
 
160 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  46.55 
 
 
152 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
152 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.94 
 
 
153 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  30.89 
 
 
156 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  26.83 
 
 
157 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 
159 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.61 
 
 
181 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  33.78 
 
 
498 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  33.07 
 
 
169 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  31.09 
 
 
171 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
149 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  30.33 
 
 
157 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.1 
 
 
154 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 
155 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 
155 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
159 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  32.82 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.38 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.1 
 
 
153 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  33.04 
 
 
153 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.38 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 
167 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 
151 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.38 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
165 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
157 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  42.37 
 
 
164 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.34 
 
 
153 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
153 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.1 
 
 
153 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 
168 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  34.41 
 
 
203 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
150 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.27 
 
 
150 aa  49.3  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.45 
 
 
181 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  45.28 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  45.28 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  24.59 
 
 
156 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 
157 aa  48.9  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 
159 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  45.28 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.28 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
153 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.95 
 
 
154 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
157 aa  48.5  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  29.75 
 
 
155 aa  48.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  45.61 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 
166 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  33.62 
 
 
153 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
166 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
175 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0797  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95017  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
180 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
172 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
140 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>