More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2661 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2661  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 342 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  30.54 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  30.21 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  30.09 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.31 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 		 140 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.66 
 
 		 156 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  32.85 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  28.47 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 173 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 140 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 156 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 162 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 		 159 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  31.91 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 162 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.58 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 159 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  27.61 
 
 		 148 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 160 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 157 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 151 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 166 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 165 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 140 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  24.67 
 
 		 165 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 162 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 		 177 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 173 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 153 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  32.31 
 
 		 162 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 154 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 159 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0349  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 151 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0342  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 151 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.42 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 142 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 176 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  32.31 
 
 		 162 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  28.87 
 
 		 169 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 176 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 157 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 162 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 176 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.34 
 
 		 153 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 165 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 151 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  33.61 
 
 		 162 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 		 161 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 		 157 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 169 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4193  transcriptional regulator, AsnC family  22.6 
 
 		 153 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.209273  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 140 aa  53.5  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 159 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 180 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 172 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 169 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 168 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 164 aa  53.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 153 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 168 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 198 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 198 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 172 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 172 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 		 158 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 154 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 151 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 151 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>