More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3614 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  97.53 
 
 		 163 aa  317  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3605  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.641359  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  29.68 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 153 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  28 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  28 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  28 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.66 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  30.14 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  29.77 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 153 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  27.33 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  29.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  25.93 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>