More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2890 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  78.42 
 
 		 145 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  78.42 
 
 		 145 aa  218  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  51.8 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  51.08 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  48.95 
 
 		 148 aa  133  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  51.08 
 
 		 141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  47.14 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  48.57 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 175 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  38.69 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  30.66 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  34.33 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.58 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 295 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  33.88 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>