More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3770 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  78.72 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  78.01 
 
 		 141 aa  225  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  73.57 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  75.71 
 
 		 140 aa  209  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  67.38 
 
 		 175 aa  189  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  59.29 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  57.86 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  47.48 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  45.32 
 
 		 148 aa  120  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  45.93 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  45.93 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  45.19 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  39.42 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  41.04 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 154 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  37.04 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 193 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 193 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 295 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  37.23 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  37.19 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.58 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>