More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1252 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 152 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.14 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  38.41 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 193 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 193 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 295 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  43.18 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  38.69 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  35.16 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  35.04 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  35.61 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  37.88 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  34.85 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  34.09 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.09 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5478  AsnC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412083  normal  0.963239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.79 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  35.11 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.65 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>