244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1587 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.2 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  26.42 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.55 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  28.44 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  28.07 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.93 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.03 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.55 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.55 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.55 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.55 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.03 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.23 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.13 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.55 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.43 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.13 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  22.95 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.56 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  23.53 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  28.32 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  26.36 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  22.22 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.23 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  25.47 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.23 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.23 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.23 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  28.18 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.66 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.23 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.55 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.66 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  24.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  24.76 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.66 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1385  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.990948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  24.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  24.76 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  27.03 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  26.23 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 168 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  25.44 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  25.2 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  23.53 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.66 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  22.97 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  22.97 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>