154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1855 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
85 aa  167  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  82.14 
 
 
85 aa  149  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  86.08 
 
 
81 aa  143  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  77.38 
 
 
85 aa  138  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  55.13 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  55.13 
 
 
80 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 
80 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 
80 aa  87  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.44 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
79 aa  60.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
81 aa  57  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.43 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
80 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  34.38 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  30.86 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  26.83 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
144 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
163 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  38.18 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.18 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  36.21 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
168 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  32.2 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  30.51 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.14 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.36 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  34.92 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  27.03 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  27.03 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 
162 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  31.75 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
167 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2808  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
76 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0149144  hitchhiker  0.005471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  37.74 
 
 
153 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
143 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
94 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  24.68 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  26.87 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30.43 
 
 
150 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.36 
 
 
153 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 
78 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.36 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  29.49 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>