181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1185 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
81 aa  160  7e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  86.08 
 
 
85 aa  143  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  84.81 
 
 
85 aa  142  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  81.01 
 
 
85 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  56.25 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  55 
 
 
80 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  53.75 
 
 
80 aa  90.5  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  52.5 
 
 
80 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.44 
 
 
77 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
79 aa  60.8  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
80 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
177 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  39.68 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  41.27 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  33.87 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
163 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
159 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
143 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  36.92 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
163 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.25 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.89 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  35.09 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  36.51 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  36.51 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  36.51 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  36.51 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.99 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  38.18 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.18 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
170 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  34.92 
 
 
162 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.48 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  24.66 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.29 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  30.88 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
76 aa  42.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  38.18 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  26.58 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30.43 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>