90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0884 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
91 aa  186  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  48.89 
 
 
94 aa  93.6  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
91 aa  91.3  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  45.56 
 
 
95 aa  88.2  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  41.76 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  45.56 
 
 
93 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 
91 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  40.66 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.33 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 
93 aa  83.6  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
94 aa  80.1  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  41.11 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  38.89 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  41.11 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
77 aa  48.9  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  40 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
76 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  23.17 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  42.62 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  36.92 
 
 
485 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  26.39 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.58 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  21.92 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  32.2 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  24.68 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
141 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
77 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  27.94 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0889  transcriptional regulator, AsnC family  26.98 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  27.94 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  24.05 
 
 
86 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>