88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3611 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 77 aa  155  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  93.51 
 
 		 77 aa  150  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  79.22 
 
 		 77 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  75.32 
 
 		 77 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  77.63 
 
 		 82 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  76.62 
 
 		 77 aa  123  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  75.32 
 
 		 77 aa  121  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 77 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  72.37 
 
 		 77 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  67.95 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  75.32 
 
 		 77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 79 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  70.13 
 
 		 78 aa  106  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  62.34 
 
 		 77 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  64.94 
 
 		 77 aa  100  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  58.44 
 
 		 77 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  60 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  51.39 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  34.25 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  43.84 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1339  hypothetical protein  33.82 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000568918 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  28 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 76 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 327 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  34.43 
 
 		 460 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>