79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5986 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
77 aa  149  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  75.32 
 
 
77 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  76.62 
 
 
77 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  72.37 
 
 
77 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  72.37 
 
 
77 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  72.73 
 
 
77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  70.13 
 
 
77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 
77 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  68.42 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  70.13 
 
 
79 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  67.53 
 
 
79 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  62.34 
 
 
77 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  71.43 
 
 
77 aa  100  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  62.34 
 
 
77 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  63.64 
 
 
77 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  68.83 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  63.64 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  59.46 
 
 
80 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 
80 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  55.07 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  62.32 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  62.32 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  62.32 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  58.67 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
76 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  35.62 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  35.62 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
92 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  41.89 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
342 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
81 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
85 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
162 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>