103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3444 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
77 aa  150  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  90.91 
 
 
77 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  83.12 
 
 
77 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  81.82 
 
 
77 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  75.32 
 
 
77 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  76.32 
 
 
82 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  75.32 
 
 
77 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  76.62 
 
 
77 aa  120  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  70.13 
 
 
77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  73.08 
 
 
79 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  70.13 
 
 
79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  79.22 
 
 
78 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  79.22 
 
 
77 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  71.43 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  66.23 
 
 
77 aa  106  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  64.94 
 
 
77 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  63.64 
 
 
77 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  62.16 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  59.46 
 
 
80 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  65.33 
 
 
79 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  61.97 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  61.97 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  61.97 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
81 aa  62.8  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  39.47 
 
 
76 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  39.47 
 
 
76 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
82 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
82 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
82 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  42.25 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
97 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
94 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 
98 aa  47  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
78 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 
460 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  33.33 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  33.8 
 
 
475 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  36.11 
 
 
448 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
91 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
167 aa  42  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
88 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1853  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
168 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.199579  normal  0.332251 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1339  hypothetical protein  33.8 
 
 
84 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000568918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  35.19 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  29.17 
 
 
489 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.51 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>