67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2809 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
77 aa  153  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  61.84 
 
 
76 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  59.21 
 
 
76 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  44.74 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  44.74 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
76 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  48.65 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.99 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
78 aa  57  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
77 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  41.79 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  36 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  34.67 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.51 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  32.43 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  30.88 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
93 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
138 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
86 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>