111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0029 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 94 aa  189  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  52.69 
 
 		 93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.69 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  49.46 
 
 		 94 aa  104  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  46.74 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  46.24 
 
 		 93 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  48.91 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  46.24 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  45.05 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  47.83 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  42.39 
 
 		 92 aa  94.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  42.39 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  43.62 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  46.24 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.76 
 
 		 95 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  45.65 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  43.01 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  43.48 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  42.39 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  38.04 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  45.07 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.84 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  30.38 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  40 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  33.85 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  42.25 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1853  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.199579  normal  0.332251 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  34.55 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 153 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 78 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 85 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0854  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 72 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000145562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>