54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3607 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 78 aa  154  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1601  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.311152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 79 aa  47.4  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 78 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>