94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2790 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
77 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  81.82 
 
 
77 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  81.82 
 
 
77 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  71.43 
 
 
77 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  71.43 
 
 
77 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  72.73 
 
 
77 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  69.74 
 
 
82 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  74.03 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  67.53 
 
 
79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  70.51 
 
 
79 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  66.23 
 
 
77 aa  110  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  74.03 
 
 
77 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  70.13 
 
 
77 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  71.43 
 
 
78 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  61.04 
 
 
77 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  58.44 
 
 
77 aa  97.1  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  58.44 
 
 
77 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  65.33 
 
 
79 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  56.76 
 
 
80 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  56.76 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
76 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  35.62 
 
 
76 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  35.62 
 
 
76 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
92 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  43.66 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
76 aa  52  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
94 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
80 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  28.38 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  32.88 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
75 aa  42  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1339  hypothetical protein  35.21 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000568918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  29.58 
 
 
92 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
76 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
76 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  27.03 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
76 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.51 
 
 
156 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>