76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0460 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
76 aa  147  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  54.17 
 
 
77 aa  82.8  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2808  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
76 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0149144  hitchhiker  0.005471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0598  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
76 aa  53.9  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
162 aa  53.9  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
92 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
91 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
83 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  40.68 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  34.78 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.56 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
80 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 
145 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  31.88 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  31.88 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  34.43 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.33 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  29.51 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 
164 aa  40  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
95 aa  40  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  31.82 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  33.93 
 
 
165 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
77 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>