45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0210 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  100 
 
 		 77 aa  149  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 76 aa  87  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  44.29 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.07 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1339  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000568918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  37.84 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.56 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>