51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0619 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  149  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  57.53 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.33 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.21 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 77 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2808  AsnC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0149144  hitchhiker  0.005471 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0598  AsnC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  39.71 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1339  hypothetical protein  31.82 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000568918 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 79 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 80 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.86 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>