114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2286 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  63.33 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  56.52 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.94 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 		 93 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  47.31 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  49.45 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  53.33 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  47.31 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  44.57 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 		 93 aa  90.1  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  44.09 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  42.86 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  43.01 
 
 		 93 aa  88.6  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.83 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  41.11 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  42.39 
 
 		 93 aa  83.6  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  43.01 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  43.96 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  43.04 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  43.04 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  36.25 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.21 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  32.05 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  30 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 86 aa  42  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  25.64 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  22.37 
 
 		 77 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>