117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0627 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
80 aa  155  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  88.75 
 
 
80 aa  147  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  87.5 
 
 
80 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  87.5 
 
 
99 aa  144  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  53.16 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  53.75 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 
85 aa  87  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  48.78 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  50.65 
 
 
86 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
79 aa  67  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 
81 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.99 
 
 
77 aa  61.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.33 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  39.19 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
77 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
162 aa  48.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.58 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
79 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
77 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  30.65 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  28.38 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  32.76 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  32.05 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.33 
 
 
92 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  27.87 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  27.85 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  27.03 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  35.94 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
176 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  25.97 
 
 
92 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  31.03 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  23.94 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>