49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0710 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 83 aa  67  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.67 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  27.03 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.9 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.59 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  35.59 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.2 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.2 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.2 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.9 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  26.03 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.9 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 75 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 78 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  23.94 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  27.54 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 91 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>