138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2295 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  72.15 
 
 		 83 aa  121  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  36.25 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.14 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.78 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  34.57 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  29.27 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  29.27 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  29.27 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2808  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0149144  hitchhiker  0.005471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  30.86 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  27.16 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  28.05 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1853  AsnC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.199579  normal  0.332251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  30.86 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  35.53 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  28.92 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  29.11 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 97 aa  42  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4811  transcriptional regulator, AsnC family  30.38 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.93 
 
 		 152 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  33.93 
 
 		 152 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.58 
 
 		 153 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.93 
 
 		 152 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.93 
 
 		 152 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.93 
 
 		 152 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 77 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>