23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1183 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 		 77 aa  159  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.67 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.56 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 83 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>