52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0869 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
104 aa  206  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
80 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.33 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
76 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0598  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  27.78 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.76 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
92 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1339  hypothetical protein  34.78 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000568918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
142 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
91 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
142 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
140 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>