34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1275 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
76 aa  149  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  57.89 
 
 
76 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1601  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.311152  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
77 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.08 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>