93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1277 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 76 aa  148  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1601  transcriptional regulator, AsnC family  75 
 
 		 76 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.311152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  71.05 
 
 		 76 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  73.68 
 
 		 76 aa  111  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  30.88 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.67 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4811  transcriptional regulator, AsnC family  27.87 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  30.86 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  27.87 
 
 		 165 aa  42  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 92 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 79 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 158 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 77 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.67 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  26.23 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.62 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5854  transcriptional regulator AsnC family  33.33 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  25.68 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 		 171 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 81 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>