51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1472 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 88 aa  181  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  51.9 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  49.37 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  49.37 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  49.37 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 78 aa  57  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  33.33 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  35.44 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  34.18 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  32.91 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  25.32 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 77 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  27.16 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>