64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0651 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 78 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 78 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 78 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 78 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  65.38 
 
 		 78 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  65.38 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 		 78 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  64.1 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  65.38 
 
 		 78 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 78 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  65.38 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 79 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 81 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  56.41 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 81 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 81 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  51.28 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  57.69 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.65 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 148 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>