42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2032 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  75.32 
 
 		 78 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 78 aa  103  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 78 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 78 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  61.33 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  61.33 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  60 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  47.3 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  47.3 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.95 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 92 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 		 94 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 92 aa  40.8  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>