120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3129 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  75.82 
 
 		 94 aa  146  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 95 aa  141  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  72.53 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  70.33 
 
 		 91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  72.83 
 
 		 95 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  71.74 
 
 		 93 aa  134  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  67.39 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  68.48 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  66.3 
 
 		 93 aa  126  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  64.84 
 
 		 95 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  67.39 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  61.96 
 
 		 93 aa  117  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  61.54 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  64.13 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  57.78 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  57.61 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  56.52 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  57.61 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  52.17 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  51.11 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  52.22 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  48.35 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 92 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  52.75 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  40.51 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  40.51 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  29.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  34.38 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  44.26 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  35.48 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1601  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.311152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.95 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  40.98 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 85 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  28.74 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>