More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2838 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  333  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  49.06 
 
 
161 aa  151  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 
159 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  41.51 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  42.77 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  36.48 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  42.77 
 
 
162 aa  131  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
167 aa  130  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 
162 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
160 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  38.99 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 
160 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  42.14 
 
 
162 aa  124  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  41.51 
 
 
163 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
178 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  39.38 
 
 
160 aa  121  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  39.52 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  37.11 
 
 
165 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  36.48 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  35.85 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  35.85 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  35.4 
 
 
164 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
163 aa  107  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
163 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
163 aa  104  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 
161 aa  104  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  33.54 
 
 
162 aa  103  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
163 aa  100  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  32.7 
 
 
162 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
161 aa  98.6  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  31.45 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  27.13 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  27.14 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  26.35 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  27.41 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  23.94 
 
 
176 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  27.78 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  23.53 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  24.46 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
168 aa  58.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  23.91 
 
 
141 aa  57.8  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  22.86 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  22.86 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  22.86 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  22.86 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  23.74 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  26.19 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  23.97 
 
 
164 aa  57.8  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  23.57 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  23.29 
 
 
164 aa  57.4  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  26.19 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  24.64 
 
 
142 aa  57.4  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  26.19 
 
 
156 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  22.86 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  25 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  22.86 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  26.19 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  23.57 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  36.9 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  22.86 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  22.86 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  26.19 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  22.86 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  22.14 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  22.14 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  22.14 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  24.53 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>