More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2209 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
159 aa  322  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  74.84 
 
 
159 aa  245  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  66.25 
 
 
160 aa  221  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  66.25 
 
 
160 aa  221  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  64.71 
 
 
160 aa  203  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  58.44 
 
 
162 aa  195  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  58.44 
 
 
159 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  54.49 
 
 
167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  55.56 
 
 
178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  52.2 
 
 
160 aa  176  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  52.2 
 
 
160 aa  176  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  51.57 
 
 
160 aa  171  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 
165 aa  167  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  50.98 
 
 
165 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 
166 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
168 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
168 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  52.14 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
168 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 
165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
164 aa  164  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  49.67 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  49.67 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
162 aa  158  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  47.74 
 
 
164 aa  153  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
159 aa  147  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 
161 aa  147  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
163 aa  140  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
163 aa  134  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
163 aa  131  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
162 aa  132  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
161 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
162 aa  123  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 
164 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
163 aa  97.1  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  24.11 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  24.65 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  29.52 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
145 aa  60.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  23.78 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1178  regulatory protein AsnC/Lrp family  27.78 
 
 
169 aa  60.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  27.34 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  25.37 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  23.57 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  25.55 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  25.18 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  27.59 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
174 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  26.09 
 
 
158 aa  58.2  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>