More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2150 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
164 aa  330  4e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  71.34 
 
 
162 aa  238  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  70.12 
 
 
161 aa  232  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  66.46 
 
 
162 aa  223  8e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  68.9 
 
 
161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  57.32 
 
 
162 aa  186  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  40.24 
 
 
162 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  41.51 
 
 
163 aa  132  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  40.24 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  38.12 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
163 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
163 aa  124  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
159 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  39.62 
 
 
163 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  37.74 
 
 
178 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  35.4 
 
 
160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
166 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
165 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 
163 aa  114  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 
159 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  37.27 
 
 
164 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
165 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 
165 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
168 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
168 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
168 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
160 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
159 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
162 aa  100  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  34.18 
 
 
161 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
196 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  29.08 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3718  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  32.56 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  27.21 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  25.53 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  26.81 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>