More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1770 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
161 aa  329  9e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  51.61 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 
160 aa  148  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 
159 aa  147  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  48.43 
 
 
162 aa  146  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 
162 aa  143  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 
162 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
159 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
167 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 
165 aa  136  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  45.51 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  46.31 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  42.77 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  42.04 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 
162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 
163 aa  124  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 
163 aa  124  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
160 aa  124  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
163 aa  123  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
165 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
159 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
165 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
168 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
168 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  41.4 
 
 
165 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
168 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 
165 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
164 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  36.65 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  35.8 
 
 
162 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  35.4 
 
 
161 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  34.18 
 
 
164 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  32.69 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
163 aa  90.5  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32.06 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  30.66 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  30.88 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  29.93 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  26.62 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  27.52 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  28.78 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  31.34 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  31.34 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  28.39 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  30.15 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  28.39 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  28.39 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  24.64 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  30 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  27.27 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  27.97 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  25.53 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1442  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  27.46 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  25.85 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  25.53 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  25.53 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  25.53 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  27.66 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>